在教廷内部，方济各强化教廷财务透明度，改革梵蒂冈行政体系，引发传统派系不满。有保守派批评他“稀释教义”，从未停止过对他的反抗。另一边，方济各在堕胎、同性婚姻、给女性授圣职等问题上的保守立场，也让部分自由派也对他感到失望，因为他虽然愿意谈论这些问题，但往往不愿做出重大改革。

譬如，方济各反对同性婚姻，却呼吁神职人员对“非传统家庭关系”持欢迎态度，比如同性恋者、单亲家庭或未婚同居的伴侣。他曾支持同性伴侣享有“民事结合”的法律权益，但也批准梵蒂冈发布声明，禁止神职人员为同性伴侣举行祝福仪式，后来又推翻了这一决定。

美国《纽约时报》观察认为，方济各任内对于气候变化、贫困、移民等全球性问题的关注，也是其策略的一部分，旨在让教会远离堕胎和同性恋等分裂性议题。一些方济各的支持者认为，他试图通过这种温和的方式促成广泛共识，从而建立一个更具协商精神、权力下沉的“共议型教会”，逐步将决策权从罗马向地方主教团与基层神职人员下放。

改善对华关系

在国际事务上，方济各多次表达希望改善与中国的关系。中国同梵蒂冈没有建交，但在2018年，中梵首次签署了关于主教任命的临时性协议，被视为是中梵双边关系的历史性突破。此后，双方又分别在2020年和2022年两度将该协议延期2年。

这份协议曾引发教会保守派人士的反对。2020年，时任美国国务卿蓬佩奧还专程前往梵蒂冈，试图阻止协议的延长，但未成功；其会见方济各的要求，也遭到婉拒。”梵蒂冈报纸当时刊登文章，驳斥国际政坛上“以地缘政治学”揣测教廷的思路，强调协议利于“整个国际社会的公益”。

去年10月，中方证实，经友好协商，中梵决定将该临时协议再延期4年。“中梵双方均对协议执行的成效予以积极评价，”外交部发言人林剑在例行发布会上说，“双方将本着建设性精神保持接谈，持续推进中梵关系改善。”

2020年2月14日，国务委员兼外长王毅在慕尼黑应约会见梵蒂冈外长加拉格尔。这也是中梵外长首次举行会晤，王毅当时表示，这是一段时间以来中梵交往的继续，也将为今后双方的往来开启更大的空间。加拉格尔则代表方济各和国务卿转达教廷对中方的敬意和支持，表示相信中方有智慧和勇气早日战胜疫情。

在担任罗马天主教教皇的12年间，方济各多次公开表达对中国的热爱和祝福。在临时协议签署之前，方济各2016年接受香港《亚洲时报》采访表示，对他而言，中国一直是“伟大的参照”，“不仅仅是一个（伟大的）国家，也是一种伟大的文化，有着无穷的智慧”。

他回忆，2014年从罗马飞往到韩国途中，当他得知自己将要第一次飞越中国领空并向中方发电问候时，他为飞越“这片文化与智慧的伟大聚集地”而感到“非常激动”。

当被问及中国的发展和开放，会对世界带来哪些“挑战”时，方济各说：“畏惧永远不是良策。”他表示，每个人都拥有找到共存之道、相互尊重和欣赏之道的能力。“毫无疑问，（中国）如此丰富的文化、如此丰富的智慧，以及如此丰富的技术知识……不可能永远封闭于一国之内。”

方济各认为，人类的文明和知识天然具有外溢性，倾向于互相交流。他提到16世纪来华传教的意大利传教士利玛窦，“利玛窦的经历教育我们，和中国对话是必要的，因为该国是智慧与历史的累积”。

《亚洲时报》专访：方济各敦促世界不要害怕中国的崛起 《亚洲时报》报道截图

2023年9月初，方济各飞越中国领空时按惯例向中国发来问候，对中国人民致以良好祝福并祈愿团结与和平。外交部发言人当时应询表示，梵方的祝福体现了友好和善意。中方愿继续与梵方相向而行，进行建设性对话，推进双方关系改善进程。

几天后，方济各在蒙古国发表即兴演讲，祝愿所有中国人民一切顺利。之后，方济各的乌克兰问题特使祖皮枢机主教被证实即将访华，与中国政府欧亚事务特别代表李辉举行会见。2024年8月，两人再度在电话上交谈，就乌克兰危机当前局势、和谈进程等交换意见。

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