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美国科学院院报:暴发根源A类毒株相当多见于非东亚地区
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柳叶刀不爱吃鱼的大狗
最后更新: 2020-04-13 12:02:52【文/观察者网 程小康】新冠病毒到底从哪里来?一直是国内外舆论关注的焦点。因为武汉疫情最先爆发,美国的一些政客在公开场合总是嚷嚷着“武汉病毒”、“中国病毒”,试图污名化中国。
近期,关于新冠病毒起源问题的研究有了新进展。最新的研究发现,新冠A类与C类毒株相当多的比例在东亚以外地区被发现,B类在东亚国家,尤其中国大陆境内常见。
A类病毒相当多发现于非东亚地区
4月8日,一篇由英国和德国学者共同撰写的论文,在国际知名学术期刊《美国科学院院报》(PNAS)上发表,文章题为《Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes》,第一作者为剑桥大学的Peter Forster博士。
截图自《美国科学院院报》官网
论文内容显示,研究人员按照进化关系,将新冠病毒变种分为A、B、C三类,A类与C类有相当多比例在东亚以外地区被发现。相反,B类是东亚最常见的类型,B类的原始类型似乎没有传到东亚以外,直到最初的突变产生B类衍生型后才传出去。这一现象指向奠基者效应或东亚以外对B类原始型在免疫上或环境上的抗性。
2月3日,中国科学院武汉病毒研究所在《自然》杂志上发表的题为《A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin》论文,新冠病毒的基因组与蝙蝠冠状病毒序列RaTG13相比,具有近96%的相似性。基于此研究,Peter Forster博士的研究团队,在其论文中将蝙蝠携带的冠状病毒设定为起源。
截图自《自然》杂志官网
该研究团队使用了160个完成的病毒基因样本,标记为A、B、C三类。这些样本在2019年12月24日至2020年3月4日期间,采集自世界各地。
因为A类毒株与蝙蝠身上的冠状病毒序列RaT13G相似,该研究团队将A类设定为“暴发根源(the root of the outbreak)”。
该论文指出,根据同一突变T29095C,A类可以明显分为两个子簇。在T突变子簇里,四个中国个体(来自华南沿海省份广东)携带原始类型,三个日本和两个美国病人与之不同,有一些突变差异。这些美国病人都有武汉居住史。
C突变子簇里有相当长的突变分支,包括5个武汉个体,其中两个显示在原始节点里。还包括8个来自中国和邻国的东亚人。在C突变子簇里几乎一半的类型(15/33),在东亚以外被发现,主要在美国和澳大利亚。
论文数据表格
在论文的原始数据表格里, 针对C突变子簇,中国有12个(标红),包括台湾、香港个1个。美国7个(标蓝),澳大利亚5个(标紫),欧洲3个(标绿),除东亚外的东亚国家6个(标白)。可见,C突变子簇中,非东亚国家占比15/33。
B类型病毒是包括中国在内的东亚国家主要传播类型,其中中国内地占大多数。最后一种C类病毒,是欧洲的主要类型,在法国、意大利、瑞典和英国的早期病患中都有发现,160个样本中,中国大陆地区没有出现该类型病毒,但在中国香港、中国台湾、新加坡、韩国有发现。
值得注意是,有业内专家指出,蝙蝠冠状病毒序列RaTG13与新冠病毒虽然接近,但要用来确定“祖先”还差得太远。
对于该篇论文,英国爱丁堡大学的分子进化生物学家Andrew Rambaut,连发推特,提出强烈质疑:“这篇文章有许多地方都犯了大错,包括内容、发现和发布的途径”、“首先是试图用蝙蝠病毒RaTG13给新冠树定根。这是最接近的非人病毒,但和新冠仍有超过1100个核苷酸的差异。然而请注意,由于某些原因,图上连蝙蝠的分支比1100个核苷酸短些”、“实际上,关于内容我想说的就这么多,根定错了,所有的结论(包括《每日邮报》里的那些)都得不到支持了”。
- 责任编辑: 柳叶刀 
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